Глушкова нашла мертвым в его доме в Лондоне вечером 12 марта 2018 года его дочь Наталья. Как сообщила полиция, при вскрытии выяснилось, что его задушили. Полицейские заметили, что накануне возле его дома дежурил фургон Volkswagen и попросили общественность сообщить о любых данных, которые могут помочь расследованию. По делу пока не проводили арестов и никого не допрашивали.
В 2017 году Глушкова заочно приговорили к восьми годам колонии, признав виновным в хищении у «Аэрофлота» 122,6 миллиона долларов. По версии следствия, Глушков вместе со своим другом и деловым партнером Борисом Березовским убедил руководство «Аэрофлота» получать валютные займы через контролируемую ими компанию, а также перечислять через нее все платежи за использование российского воздушного пространства. В 1996-1999 годы на счета компании поступило 400 миллионов долларов, из которых 123 миллиона, по версии Следственного комитета, похитили.