Дело возбудили в феврале 2017 года, а закрыли уже в декабре после того, как СИБЭКО доплатила налоги за 2011 год. В ходе расследования из дела выделили часть материалов, которые, по мнению следователей, «могли свидетельствовать о совершении валютных операций по переводу денежных средств в иностранной валюте или валюте Российской Федерации на счета нерезидентов с использованием подложных документов» со стороны руководителей СИБЭКО.
Проверку по сделке между СИБЭКО и зарегистрированной на Кипре Blacksiris Trading Ltd в 2013 году по покупке 100% акций трех ремонтно-сервисных компаний проводил отдел экономической безопасности и противодействия коррупции УМВД по Новосибирску. УМВД вынесло отказ в возбуждении дела, не обнаружив в действиях руководства компании признаков состава преступления. В постановлении полицейские отмечали, что компания и ее акционеры не были аффилированы с компанией Blacksiris Trading Ltd, приобретение акций было согласовано с ФАС, а для оплаты использовалась прибыль компании.
РБК отмечает, что возбуждение дела совпало по времени с протестами из-за повышения тарифов в Новосибирской области. Основным поставщиком энергии в регионе была СИБЭКО. В декабре 2016 года губернатор Владимир Городецкий подписал распоряжение о повышении тарифов на коммунальные услуги на 15–20%, ссылаясь на необходимость ремонтировать изношенные сети. Однако повышение тарифов было отменено в том числе после публикации Алексея Навального об итальянской вилле Абызова в апреле 2017 года.
В марте 2019 года Абызова арестовали по обвинению в создании организованного преступного сообщества (ст. 210 УК) и мошенничестве на четыре миллиарда рублей (ст. 159 УК). По версии следствия, сделка СИБЭКО с Blacksiris повлекла ущерб для миноритариев компании, а также создала угрозу «устойчивому экономическому развитию и энергетической безопасности ряда регионов страны».