Бородин занимался темами коррупции, преступности и политикой России за рубежом. Он скончался 15 апреля — через три дня после того, как его тело нашли под балконом его квартиры. Полиция рассматривает это дело как самоубийство.
В последние недели Бородин активно освещал ситуацию с гибелью российских наемников в Сирии. Он выяснял имена погибших, чьи тела возвращали в родные места для похорон. Это резко контрастировало с заявлениями Минобороны РФ о якобы отсутствии потерь среди российских бойцов в результате авиаудара 7 февраля, хотя свидетельства говорили об обратном.
По утверждению полиции, квартира Бородина была заперта изнутри, признаков взлома не обнаружено. Главный редактор издания «Новый день» Полина Румянцева, где работал Бородин, не согласна с мнением полиции. По ее словам, она не верит в версию о самоубийстве. Предсмертной записки на месте происшествия найдено не было.
Друг Бородина Вячеслав Башков в записи в Facebook 15 апреля также отверг возможность добровольного ухода журналиста из жизни. Как сообщил Башков, Бородин связывался с ним за день до инцидента и сказал, что его дом окружен сотрудниками спецназа в камуфляже. Журналист полагал, что они ждали судебного ордера на обыск его квартиры, и просил Башкова найти ему адвоката. Час спустя Бородин перезвонил другу и заявил, что ошибся — полиция просто проводила учения. Комментарии к этой записи в Facebook указывают на то, что Бородин в то утро связывался с несколькими людьми.
После того момента Башков и Бородин не общались. Башков категорически отвергает мнение о том, что Бородин якобы употреблял наркотики или был психически неуравновешен. По словам Башкова, в этом случае «он не смог бы выполнять свою работу».
В конце 2017 года Бородин и его коллега подверглись нападению неизвестных молодчиков. До этого Бородин дал интервью по поводу вызвавшего большие споры фильма «Матильда» о предполагаемых внебрачных отношениях царя Николая II и известной балерины. Картина разозлила группировку, называющую себя «православными воинами», которые сочли фильм «богохульным».
Организованная коллегами Бородина траурная церемония в его память должна пройти 18 апреля.