Хищения обнаружили в ходе проверки организации. Следователи установили, что в 2013–2015 годах центр заключил с предприятием «Спецстройсервис» договор подряда на выполнение работ по реконструкции и техническому перевооружению сооружений.
Центр подготовки космонавтов основан в 1960 году, он расположен в Звездном городке. Центр специализируется на отборе и подготовке космонавтов.
Параллельно — в мае 2021 года — прошла проверка МВД в отношении руководства другого предприятия «Роскосмоса» — НПО им. Лавочкина, которое занимается проектированием космических аппаратов.
По версии следствия, руководители предприятия присвоили 332,5 миллиона рублей. Чтобы скрыть это, они подписывали поддельные договоры за мнимое оказание юридических услуг. Всего в 2019–2020 годах следственные органы возбудили 22 уголовных дела по материалам службы внутреннего аудита «Роскосмоса».