Жапаров заявил, что на сегодня «если один из подозреваемых соглашается сотрудничать и предоставляет информацию о преступлении, то происходит привлечение к ответственности без определения виновности или отсутствия таковой». По его мнению, это приводило к попыткам властей «посадить своих политических оппонентов или тех, кто не нравится».
Осенью 2020 года Государственный комитет национальной безопасности Киргизии сообщил, что с начала 2016 года по настоящее время Матраимов управлял коррупционной схемой по извлечению теневых доходов при таможенном администрировании.
Первым о схеме вывода денег из Киргизии рассказал OCCRP. Одним из информаторов для расследований выступил бизнесмен Айеркен Саймаити. Он признал, что незаконно вывез из страны более 700 миллионов долларов и заявил, что коррупционная сеть была налажена с помощью тогда еще зампреда таможни Матраимова.
Жапаров в первом обращении к гражданам на посту президента обещал «поставить точку» в деле о выводе 700 миллионов долларов из страны. «Основной подозреваемый Матраимов и другие коррупционеры понесут наказания перед нашей страной», — утверждал он.
Однако после того, как Матраимов подписал соглашение о сотрудничестве со следствием и пообещал возместить ущерб в два миллиарда сомов, его отпустили под подписку о невыезде. Кроме того, OCCRP и «Клооп» выяснили, что структура этих компенсационных выплат непрозрачна. Примерно треть суммы – это оценочная стоимость десяти объектов недвижимости, которые Матраимов купил за несколько дней до передачи государству. В чем смысл такой схемы — пока неизвестно.