Следствие установило, что Зайцев с 2007 по 2010 годы не только переоформил участок в нескольких километрах от поселка Шира на знакомого, но и изменил его категорию с земель сельскохозяйственного назначения на земли промышленности. Зайцев поручил подчиненным подписать документы сначала на аренду участка за 50 тысяч рублей в год, а затем на его покупку за пять миллионов рублей.
Ущерб от действий чиновника следствие оценило в шесть миллионов. В СК заявили, что Зайцев знал, что на этом месте за бюджетный счет будет построен полигон для отходов и что эта земля перейдет в собственность муниципалитета и впоследствии достанется району бесплатно.
В числе собственников земли оказался адвокат главы района Павел Двигун, уточнили в региональном управлении СК.
Подозреваемыми в деле также числятся «иные неустановленные лица». Дело возбудили по статье «Превышение должностных полномочий, с причинением тяжких последствий» (п. «в» ч. 3 ст. 286 УК РФ).
23 мая Сергей Зайцев в служебном кабинете напал на журналиста телеканала «Россия-24» Ивана Литомина. Журналисты сообщили, что собирались спросить его, «почему жители района, пострадавшие от природных пожаров четыре года назад, вынуждены существовать в нечеловеческих условиях». В отношении Зайцева после инцидента возбудили уголовное дело о воспрепятствовании работе СМИ.
В апреле 2019 Сергея Зайцева приговорили к 4,5 годам колонии-поселения по обвинению в халатности. Суд счел, что 12 апреля 2015 года Зайцев не принял необходимых мер для предотвращения степных пожаров, в результате которых в поселке Шира сгорели более 400 домов, 12 человек погибли. Сразу после приговора суда Зайцева амнистировали в честь 70-летия победы в Великой Отечественной войне.