По версии следствия, Икомасов представил поддельные акты на 5,4 миллиона рублей о якобы выполненных работах без какой-либо детализации.
В апреле 2012 года «Роскосмос» заключил договор с ФГУП «Центр эксплуатации объектов наземной космической инфраструктуры» (ЦЭНКИ). В его рамках подрядчик должен был провести летные испытания ракет космического назначения и ротацию американских членов экипажа МКС. На эти цели «Роскосмос» выделил 3,8 миллиарда рублей. Для исполнения некоторых пунктов контракта ЦЭНКИ нанял субподрядчика — ЦТП. В СК считают, что Икомасов и его пока неустановленные соучастники похитили выделенные деньги.
Икомасова и его бывшего заместителя обвиняют в аналогичных махинациях почти на восемь миллионов рублей при исполнении контракта между «Роскосмосом» и ЦЭНКИ на проведение летных испытаний с космическим кораблем «Союз-ТМА-М». Фигуранты дела, по версии следствия, похитили деньги, выделенные на создание научно-технической продукции.