По данным ГКНБ, дело возбуждено по факту отмывания денег в крупном размере на основании информации, полученной из финансовой разведки Латвии. ГКНБ утверждает, что Интерпол Риги пришел к выводу, что жена Зилалиева открыла банковские счета в одном из крупных банков Латвии на имя троих своих детей и провела через них несколько денежных переводов в особо крупных размерах.
Жена экс-чиновника Зульфия Зилалиева заявила, что у их семьи с 2016 года есть депозитный счет в Латвии, на котором хранятся 42 тысячи долларов, но на нем не проводили никаких операций последние три года. «Поэтому я требую от ГКНБ предоставить общественности документы, потому что при обыске они изъяли эти документы из квартиры и сейчас не могу доказать свои слова», — сказала она. Речь идет об обысках по делу о незаконном обогащении в отношении Зилалиева. По нему Генпрокуратура Киргизии закончила расследование и направила в суд.
Зилалиева задержали в декабре 2018 года. Следователи сообщили, что в его банковских ячейках нашли незадекларированные 900 тысяч долларов.
Сам Зилалиев заявлял, что на него давили представители следственных органов и заставляли дать показания против бывшего президента Алмазбека Атамбаева.
Зилалиева также приговорили к трем годам условно по делу о ложном сообщении о бомбе в день инаугурации президента Сооронбая Жээнбекова.