Суд признал Каитова виновным в мошенничестве в особо крупном размере и удовлетворил иск потерпевшей стороны к своему бывшему руководителю на сумму 340,1 миллиона рублей. Изначально бывшего топ-менеджера обвиняли в хищении четырех миллиардов рублей. Заявление в правоохранительные органы написало новое руководство ОАО «МРСК Северного Кавказа» после проверки.
По версии следствия, с 2007 по 2011 год МРСК заключила договоры с контрагентом ООО «Юрэнергоконсалт», который должен был собирать платежи за электроэнергию от потребителей, а также производить расчеты по поручению энергетической компании. Однако поступившие на счета деньги контрагент не полностью направлял на оплату приобретенной у генерирующих компаний электроэнергии. Часть выручки, считало следствие, перечислялась на счета фирм, связанных с Магомедом Каитовым. Он тратил деньги на покупку ценных бумаг, недвижимости и инвестировал в разные проекты, в том числе связанные со строительством и животноводством — в частности, на разведение элитных черных курдючных баранов.
Позднее к обвинению добавили статью об организации преступного сообщества, но после того, как начали судить участвовавших в расследовании оперативников ГУЭБиПК, статью убрали из обвинения.
Адвокаты обвиняемого утверждали, что Каитов не причинял ущерба, а с помощью сделок, которые легли в фабулу обвинения, МСРК получила прибыль в 142 миллиона рублей.
Оперативным сопровождением дела, которое возбудили в 2013 году, занимались сотрудники Главного управления экономической безопасности и противодействия коррупции (ГУЭБиПК) МВД во главе с Денисом Сугробовым. После задержания Каитова здание полицейского управления попытались осадить «крепкие молодые земляки задержанного», пишет «Коммерсант». Они приходили и в суд, представившись родственниками задержанного.
Каитов уволился из МРСК в ноябре 2011 года после того, как его раскритиковал занимавший тогда пост вице-премьера Игорь Сечин. Сечин обвинил сетевую компанию в использовании «серых» схем при сбыте электроэнергии, а также заявил, что Каитов «собрал себе персональные привилегии». Спустя месяц занимавший пост премьер-министра Владимир Путин заявил, что деньги потребителей электроэнергии поступали на счета аффилированных компаний Каитова, а часть полученных денег обналичивается через фирмы-однодневки или присваивается членами его семьи.