По версии следствия, руководство Таможенной службы лоббировало интересы частных компаний. Они ввозили в страну товары с нарушениями законодательства и использовали схемы по сокрытию товаров от таможни. Кроме того, следствие пришло к выводу, что руководство ведомства необоснованно завышало стоимость таможенных услуг, которые оказывали дочерние организации. В ГКНБ пока не уточнили, в чем подозревают именно Кубанычбекова.
В декабре 2021 года в интервью «Азаттыку» Адилет Кубанычбеков заявил о полном искоренении контрабанды товаров через границу. «Хочу обратиться ко всем бизнесменам: мы объявили серьезную войну контрабанде, сейчас ее нет. А те, кто хочет заниматься этим, пусть уезжает куда-нибудь», — сказал он. Чиновник также сообщил, что завершилось служебное расследование в отношении сотрудников ведомства, которых подозревали в связях с коррупционной схемой экс-зампреда таможни Райымбека Матраимова. По результатам 14 человек уволили, шесть отправили в резерв кадров.
Матраимов с 2015 по 2017 годы занимал должность заместителя главы таможни Киргизии. Журналисты из OCCRP, «Азаттыка» и «Клоопа» в нескольких расследованиях, опубликованных с 2019 года, выяснили, что за это время Матраимов наладил коррупционную схему совместно с кланом китайского бизнесмена Хабибулы Абдукадыра. Журналисты подсчитали, что с помощью этой схемы из Киргизии могли вывести 700 миллионов долларов.