По информации Следственного комитета России, 51-летнему Сердюкову инкриминируется преступная халатность при использовании бюджетных средств и материальных ресурсов, которые оказались потрачены на проведение работ в частном доме отдыха на одном из островов недалеко от Астрахани. Официальный представитель Следственного комитета сообщил, что, со слов бывшего министра, указанный объект якобы являлся «базой отдыха для сотрудников Министерства обороны», однако фактически на объект допускались лишь владельцы и их гости.
По данным комитета, работы на данном объекте обошлись российской казне в 56 миллионов рублей (около 1,7 миллиона долларов).
Сам прежний глава оборонного ведомства отрицает, что когда-либо нарушал закон.
Агентство Bloomberg обращает внимание на то, что Сердюков стал наиболее высокопоставленным чиновником из числа тех, кто был уволен за коррупцию за все годы правления Владимира Путина. Независимый политический обозреватель Дмитрий Орешкин в интервью этому агентству высказал мнение, что увольнение Сердюкова было искусственно спровоцировано влиятельными силовиками, недовольными его попытками поставить под жесткий контроль расходование средств на оборону и безопасность.
Зарубежные источники считают Россию чрезвычайно коррумпированный страной, что подтверждает 133-е место из 176, которое она заняла в 2012 году в составляемом ежегодно Transparency International Индексе восприятия коррупции. Это худший показатель из всех развитых государств. Дмитрий Орешкин отмечает в этой связи, что, если бы власти на деле были заинтересованы в обуздании коррупции, то за решетку отправились бы три четверти российских чиновников.