Дело Юрченко расследовалось с 2014 года, он находился под подпиской о невыезде. По информации следствия, губернатор допустил нарушения в 2010 году при продаже ветхого деревянного здания кожно-венерологического диспансера в центре Новосибирска. Само здание не представляло ценности, однако земля под ним стоила очень дорого. Для его продажи готовили аукцион. Но Юрченко единоличным решением отменил торги и продал здание за 20 миллионов рублей фирме «Тактика», которая входит в группу «Русские отели» Олега Дерипаски. Фирма планировала построить на месте диспансера пятизвездочную гостиницу.
Следователи пришли к выводу, что стоимость здания была занижена как минимум на 14 миллионов рублей. Также от действий Юрченко пострадала компания ««ГазТрансКом». До продажи здание находилось в пользовании этой фирмы, и она была заинтересована выкупить его на аукционе.
Суд признал Юрченко виновным, однако сумму ущерба снизил до 135 тысяч рублей. Прокурор Константин Наумкин после суда сказал журналистам, что за время чтения приговора сам не понял, на каком основании было принято это решение. По словам прокурора, после тщательного изучения приговора сторона обвинения решит, стоит ли обжаловать его как слишком мягкий. В свою очередь, адвокат Александр Балян уже однозначно заявил о намерении обжаловать приговор. По версии защиты, Юрченко должен быть признан абсолютно невиновным.
Сам Юрченко в недавнем интервью «Радио Свобода» заявил: «Понятно же, что я не виновен, и это подтверждается документами, которые собрали сами следователи: там просто нет события преступления – даже не состава, а самого события».
Помимо дела о продаже земли, в отношении Юрченко расследовалось еще одно дело. Его обвиняли в незаконном переводе земельного участка из категории земель обороны в категорию сельскохозяйственных земель. Однако это дело не дошло до суда, в феврале 2017 года его закрыли. Юрченко смог доказать, что не знал о принадлежности земли федеральным властям. А значит, он также не мог знать, что не имеет права ею распоряжаться.
Руководство Новосибирского опытного завода измерительных приборов, которое использовало земельный участок в качестве полигона, не согласно с этой версией. Директор предприятия Алексей Морозов в беседе с «Комсомольской правдой» заявил: «Есть закон, что распоряжение федеральными землями – это компетенция правительства Российской Федерации, но никак не губернатора, что произошло в данном случае. И он, как губернатор Новосибирской области, не мог не понимать, что здесь его полномочия превышены. (…) Еще в укор нам ставили: «Полигон имел низкую загрузку». Так он и должен иметь низкую загрузку в мирное время!».
Впрочем, заводу удалось оспорить изъятие полигона в арбитраже, и земля снова поступила в его пользование. Закрытие дела означает лишь, что лично Юрченко не понесет наказания за эти события.
Юрченко с 1982 по 2004 годы работал в Новосибирском производственном объединении «Сибсельмаш», где прошел путь от механика до генерального директора. Политическую карьеру он начал в 2004 году на посту руководителя департамента развития промышленности и предпринимательства администрации Новосибирской области. В 2005 году его назначили первым заместителем губернатора, а в 2010 году он стал губернатором. За два месяца до возбуждения уголовных дел президент РФ Владимир Путин снял Юрченко с должности с формулировкой «в связи с утратой доверия».
Аналитики «Радио Свобода» предполагают, что новый губернатор не смог ужиться со старой элитой. Влиятельные лица ожидали, что Юрченко станет простым преемником своего бывшего начальника Виктора Толоконского. Однако он сразу же начал увольнять ставленников Толоконского с ключевых постов и замещать их «своими людьми» (нередко приглашенными из других регионов). В итоге в отношении родственников и соратников Юрченко стали возбуждать уголовные дела, затем в интернете был анонимно опубликован компромат на семью губернатора. Финалом этой борьбы, по мнению аналитиков, и стало увольнение и уголовное преследование самого Юрченко.
