Пономарева попросила проверить контракты Фонда с Московской высшей школой социальных и экономических наук («Шанинка»), входящие в проект «Учитель будущего». Проект был частью нацпроекта «Образование». При этом заявительница не указывала конкретных имен.
Еще за месяц до подачи заявления московская полиция самостоятельно заказала у Российской академии образования (РАО) проверку этих контрактов. Forbes пишет, что не смог выяснить, из-за чего у МВД появилась необходимость в проверке.
Эксперты РАО пришли к выводу, что выполненные «Шанинкой» контракты не соответствуют требованиям техзадания, а результаты не применимы на практике, и их нельзя использовать по целевому назначению.
Через четыре дня после заявления Пономаревой, 7 августа, главное следственное управление ГУ МВД по Москве возбудило дело о мошенничестве в особо крупном размере. По версии следствия, Ракова как заместитель министра просвещения добилась финансирования для «Фонда новых форм развития образования» на исполнение проекта, а затем с сообщниками похитила деньги, которые по документам предназначались «Шанинке». Кроме Раковой, по делу задержали ректора «Шанинки» Сергея Зуева, бывшего исполнительного директора вуза Кристину Крючкову, двух директоров Сбербанка, а также гражданского мужа Раковой Артура Стеценко. По версии следствия, Стеценко фиктивно работал в фонде и получил под видом зарплаты девять миллионов рублей.
