Изначально Алахвердиева обвинили в получении взятки в особо крупном размере и в злоупотреблении полномочиями. По ним грозит до 15 лет заключения, однако генерала отпустили под подписку о невыезде и надлежащем поведении.
Следствие предполагает, что, несмотря на меру пресечения, Алахвердиев попытался создать себе алиби. Глава «Международного противоминного центра Вооруженных сил» Владимир Сидоренко в своих показаниях заявил, что Алахвердиев приезжал к нему лично и попросил подтвердить следствию, что ранее центр получил через него несколько миллионов рублей спонсорских средств, которые потратили в том числе на приемы иностранных делегаций. Полковник Сидоренко во время дачи показаний заявил, что спонсорской помощи никогда не получал.
Генерал также пытался договориться со скульпторами, которые поставляли памятники саперам, служившим в том числе в Сирии и Афганистане. Посредники Алахвердиева заявили скульпторам, что он «взял деньги и ему нужно оправдаться». Передав 2,3 миллиона рублей, сообщники фигуранта дела потребовали от скульпторов рассказать на допросе, что ранее они уже получили 3,4 миллиона рублей.
По первоначальной версии следствия, генерал с 2017 по 2021 год получил взятку в 6,7 миллиона рублей за покровительство компании «Логис», которая специализируется на научных исследованиях и разработках. Кроме того, следствие считает, что он требовал от военнослужащих выполнять работы на садовых участках у него дома, а также у своих близких знакомых.
Однако позднее в деле военного появилось еще несколько эпизодов: о взятке в несколько миллионов от руководителей «Клинцовского автокранового завода» и «Галичского автокранового завода» Андрея Сытькова, а также председателя совета директоров обоих заводов и их акционера Олега Зеленского. Предприятия поставляют военным спецтехнику.
Алахвердиев вину не признал, он настаивает, что привлекал спонсоров для установки памятников саперам.
