По версии следствия, в 2015 году Меркушкин в период работы вице-премьером Мордовии одновременно был фактическим акционером коммерческого банка Мордовпромстройбанк. Вместе с председателем совета директоров банка и еще одним акционером он передал взятку в семь миллионов рублей управляющему региональным отделением Центрального банка России. Взамен они хотели предотвратить отзыв лицензии по итогам инспекционной проверки банка.
Ранее депутат Госдумы Александр Хинштейн рассказал, что Меркушкин проходит по делу о даче взятки начальнику отделения Банка России по Мордовии Александру Тренькину. Уголовное дело против Тренькина возбудили в январе 2021 года. По версии следствия, взятку Тренькину дали топ-менеджер МПСБ Вячеслав Брыков, депутат госсобрания Мордовии от партии «Единая Россия», акционер банка Алексей Гришин и неустановленные лица. Гришина в 2020 году задержали по другому уголовному делу.
Хинштейн также опубликовал документы, из которых следовало, что претензии следователей к Меркушкину могут быть связаны и с другими делами. Так, в одном из документов СК говорилось, что председатель правления Мордовпромстройбанка Татьяна Гришина вместе с неустановленными лицами похитили 216 миллионов рублей, предназначенных для строительства выставочного центра «Мордовэкспоцентр». СК предполагал, что к этому причастен и Алексей Меркушкин как конечный бенефициар банка.
